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奉子成婚

奉子成婚

作者:贺己  时间:2017-08-03 02:02:12  人气:

作为分享2000年6月人类基因组测序荣耀的公司Andy Coghlan Celera现在面临声称其数据可能存在错误的说法加州斯坦福大学的数学家塞缪尔卡林说,多达一半的公司用于果蝇的基因序列可能包含错误他说,他的研究表明,在使用类似技术测序的其他基因组中可能存在许多错误但其他人为结果辩护美国在伯克利霍华德休斯医学研究所进行的飞行测序项目的格里鲁宾说:“我认为50%是正确的,而不是批评”他说,明年的更新应该将其准确度提高到75%当Celera的负责人克雷格·文特尔于2000年3月在“科学”杂志上发表了飞行基因组的完整序列时,鲁宾就是其中的共同作者之一该作品被誉为公司使用的“纯霰弹枪序列”技术的证明,其中副本将一个生物的DNA分解成小块并排序然后,计算机通过查找重叠片段来组装完整序列但当Karlin开始使用Celera的苍蝇基因组时,他发现了很多错误 “他们60%以上的序列存在实质性的分歧[已知序列],这让我有点生气,”他说因此,他与同事们进行了更全面的分析他们通过Celera的基因组搜索了1049个基因,这些基因的序列和功能已经制定出来,并在实验中仔细检查尽管26%的基因是精确匹配,另外29%的基因精确到1%以内,其余45%包含一系列中度至严重错误 - 或者完全失踪 “我们找不到很多我们自己研究的基因,”卡林说其他错误包括遗漏基因或外显子的整个蛋白质编码区段,而其他基因则从错误的起点“读取” Karlin声称在人类基因组的公共和私人版本中可能存在更严重的错误 “每个人都在奔波,”他说但是公共项目依赖于更慢,更准确的霰弹枪测序版本 - 而Celera最终在其版本中包含了来自公共项目的大量数据(New Scientist,2月17日,第4页)与此同时,Karlin警告研究人员如果正在研究Celera揭示的任何“新”基因,请注意 “我的建议是做你正在做的任何事情,”他说卡尔林说,他的分析揭示了过度依赖计算机的危险 “人们试图逃避而不做实验”塞莱拉淡化批评发言人希瑟科瓦尔斯基说:“我们从未说过苍蝇基因组完全和100%完整” “对基因组的注释和分析可以持续数十年”卡林的着作出现在“自然”(第411卷,第259页)中他最初将他的论文发送给了科学,但期刊没有发表 “他们坐了五个月,